黄浦江水文化博物园占地约1200亩，将以黄浦江的历史、文化为内涵，以河道、古桥、古树、石碑、雕塑、仿古建筑、展馆、广场为主要构件，以古朴、自然和野趣为格调，构成博物园的基本形态。博物园的西北角，是由水文化名人园和历史文化展示馆组成的黄浦江水文化广场。
在黄浦江水生物科普园内，人们可以领略母亲河两岸的自然美景。长约30米的江底隧道两侧安有玻璃墙，向人们展示黄浦江中丰富的鱼类资源。参观者可以踏水车，与龟鳖鸭鹅嬉戏，也可踏着石头穿过浅浅的河道，从密林之中登上中心广场的观景台一览黄浦江宽阔的江面和川流不息的航船。江岸村落民间文化展示馆，则让人们形象地了解浦江两岸原住居民的生活形态和民风民俗，再现当年民宅炊烟、水车织机、老井水桶、石板竹椅的居家环境。
黄浦江水文化博物园最富特色的，是保护母亲河的石碑和志愿者墙。为了表达市民保护母亲河的决心，一块“保护母亲河”的石碑，将矗立在黄浦江岸边的一座土坡上，这块高8米、宽4米、厚1.5米，重达120吨的天然巨石，在上海现有园林已置放的天然石碑中独一无二；长达数百米的志愿者堤墙将在大理石石板上刻上保护母亲河志愿者的名字和心声。
